中醫(yī)認(rèn)為：乙炎的病機(jī)是由于內(nèi)蘊(yùn)胎毒，外感時(shí)邪，病毒從口而入或注射，輸液、輸血等交叉感染，蘊(yùn)藏體內(nèi)，蓄積肝臟，郁久成瘀，化熱、化燥，復(fù)受七情、六淫、飲食、勞倦而誘發(fā)本病。其發(fā)病有三種情況：一是有感而即發(fā)的，這是由于邪氣獨(dú)盛，正氣虛弱之故。二是有感染后多年，機(jī)體抗病能力降低后，觸及誘因才發(fā)此病。三是正氣內(nèi)存，邪不可干，陰平陽(yáng)秘的身體，雖然感染有乙肝病毒而終生不發(fā)病的健康帶毒體。乙型肝炎的發(fā)生發(fā)展及其轉(zhuǎn)歸，與機(jī)體的免疫反應(yīng)和病毒的持續(xù)感染有關(guān)，而免疫活性細(xì)胞來(lái)源于骨髓多能干細(xì)胞，中醫(yī)認(rèn)為“腎主骨生髓”，許多免疫功能低下的患者大多與腎虛有關(guān)。腎虛則體內(nèi)核苷酸還原酶低下，從而抑制DNA合成。
乙肝在臨床上無(wú)明顯肝炎癥狀和體征，而HBV-M測(cè)定提示有病毒復(fù)制現(xiàn)象。中醫(yī)認(rèn)為其發(fā)病機(jī)理重點(diǎn)在濕熱、瘀毒、正虛三個(gè)方面。關(guān)鍵病機(jī)是疫毒蘊(yùn)結(jié)，可累及肝、膽、脾、胃、腎等臟腑。體虛不勝邪，郁毒蘊(yùn)結(jié)肝膽而致疏泄不利，脾胃運(yùn)化失司，升降紊亂，肝病日久及腎，耗損精氣，終至肝腎皆虧。由于乙肝病毒只在化驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)，常處在“無(wú)證可辨”的情況下而難以論治，因此，辨病就顯得尤為重要，一旦確診為乙肝，即可以扶正與抗毒為主的治療。這叫做“辨病論治”。
乙肝的治療大法是先辨病后辨證，使治療更具有系統(tǒng)連貫性。再在辨病與辨證的前提下結(jié)合病者的體質(zhì)差異、根據(jù)不同的病理階段，靈活運(yùn)用扶正與抗毒，并緊密結(jié)合HBsAg與HBeAg內(nèi)在聯(lián)系的辨證法為基本點(diǎn)，形成多條靈活的用藥法則，才能獲得最佳療效。如果只辨病不辨證，開(kāi)出的處方針對(duì)性不強(qiáng);如遷就病人僅憑化驗(yàn)單開(kāi)藥或長(zhǎng)期服用各種中成藥療效甚微，這是不加辨證盲目用藥的惡果。遵照“治病求本，謹(jǐn)守病機(jī)”的法則。乙肝是正虛邪實(shí)之證，以扶正與抗毒同時(shí)使用為主要治療手段。大三陽(yáng)重用解毒之劑;小三陽(yáng)重用扶正之品。動(dòng)態(tài)觀察實(shí)踐說(shuō)明HBsAg與HBeAg陽(yáng)性的關(guān)系是病邪未盡與正氣未虛和病邪未祛與正氣己傷的關(guān)系。依照具體病情制定主次先后用藥之度，使處方用藥顯得辨病不失辨證，辨證不遺辯病，二者相合，恰到好處，才能收到事半功倍之效。
