祖國(guó)醫(yī)學(xué)對(duì)肛瘺的分類較多，有不少形象描述。如《外科大成·下部后》中說(shuō)：“漏有八：腎俞漏，生腎俞穴。瓜穰漏，形如出水西瓜穰之類。腎囊漏，漏管通于囊也。纏腸漏，為其管盤(pán)繞于肛門(mén)也。屈曲漏，為其管曲屈不直，難以下藥至底也。竄臀漏、蜂窩漏，二癥若皮硬色黑，必內(nèi)有重管，雖以掛線，依次穿治，未免為多事。通腸瘺，惟以此漏用掛線易于除根。”
現(xiàn)在肛瘺分類亦多，有按病因、病理分類，有按內(nèi)外口的位置及侵犯組織的程度分類。
一、按內(nèi)外口分類
1. 單口內(nèi)瘺：又稱為內(nèi)盲瘺，只有內(nèi)口與瘺管相通連，無(wú)外口。
2. 內(nèi)外瘺：瘺管有內(nèi)外口，外口在體表，內(nèi)口在肛竇，下有瘺管相通連。此種肛瘺最為多見(jiàn)。
3. 單口外瘺：又稱為外盲瘺，只存外口下連瘺管，無(wú)內(nèi)口。此種肛瘺臨床上較少見(jiàn)。
4. 全外瘺：瘺管有兩個(gè)以上外口相互有管道通連，而無(wú)內(nèi)口，此種肛瘺臨床上較少見(jiàn)。
二、Parks分類法：按瘺管與括約肌的關(guān)系，將肛瘺分為四類：
1. 括約肌間肛瘺 （低位肛瘺），為最常見(jiàn)，約占70%，是肛管周?chē)撃[的后遺癥。瘺管只穿過(guò)內(nèi)括約肌，外口常只有一個(gè)，距肛緣較近，為3-5厘米。
2. 經(jīng)括約肌肛瘺（低位或高位肛瘺）， 約占25%，為坐骨直腸窩膿腫的后遺癥。瘺管穿過(guò)內(nèi)括約肌、外括約肌淺部和深部之間，外口常有數(shù)個(gè)，并有枝管互相溝通，外口距肛緣較遠(yuǎn)，約 5厘米。
3. 括約肌上肛瘺（高位肛瘺） ，占 5%。瘺管向上穿過(guò)肛提肌，然后向下至坐骨直腸窩而穿透皮膚。由于瘺管常累及肛管直腸環(huán)，故治療較困難。
4. 括約肌外肛瘺（呶桓仞?？，占 1%，為骨盆直腸間隙膿腫合并坐骨直腸窩膿腫的后果。瘺管穿過(guò)肛提肌，直接與直腸相通。這種肛瘺常為克隆氏病、腸癌或外傷所致。
三、按瘺管形態(tài)分類：1.直瘺;2.彎曲瘺;3.前后蹄鐵形肛瘺。
四、按肛瘺的病因和病理性質(zhì)分類：可分為非特異性肛瘺（即化膿性肛瘺）和特異性肛瘺二類。在特異性肛瘺中，又可進(jìn)一步分為：結(jié)核性肛瘺、梅毒性肛瘺和放線菌性肛瘺三種。
五、全國(guó)肛腸外科會(huì)議（1975）統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)分類法：以外括約肌深部劃線為標(biāo)志，瘺管經(jīng)過(guò)此線以上為高位，在此線以下為低位，這在國(guó)內(nèi)已普遍采用。
1. 低位單純性肛瘺：只有一個(gè)瘺管，并通過(guò)外括約肌深部以下，內(nèi)口在肛竇附近。
2. 低位復(fù)雜性肛瘺：瘺管在外括約肌深部以下，外口和瘺道有二個(gè)以上者，內(nèi)口在肛竇部位（包括多發(fā)性瘺）。
3. 高位單純性肛瘺：僅有一個(gè)瘺道，瘺管穿過(guò)括約肌深部以上，內(nèi)口位于肛竇部位。
4. 高位復(fù)雜性肛瘺：有二個(gè)以上外口及瘺管有分支，其主管通過(guò)外括約肌深部以上，有一個(gè)或兩個(gè)以上內(nèi)口。
